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二代測序在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中的應(yīng)用

時間:2023-11-27 15:38:16   來源:互聯(lián)網(wǎng)

  在過去十年中,二代測序(NextGenerationSequencing,以下稱NGS)已從一種研究方法迅速發(fā)展成為標(biāo)準(zhǔn)臨床檢測的核心組成部分,世界衛(wèi)生組織血液腫瘤分類(第五版)、美國國立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN V2023)等指南均把NGS列為重要的血液腫瘤檢測技術(shù)。在腫瘤學(xué)中,腫瘤NGS為檢測體細胞驅(qū)動突變提供了一種關(guān)鍵工具,這些突變不僅表征了疾病,還影響了治療決策。而血液系統(tǒng)惡性腫瘤是一組生物學(xué)和臨床上多樣化的起源于造血細胞的腫瘤。與源自其他器官和組織的“實體瘤”相比,血液腫瘤歷來更適合快速采用新的診斷技術(shù)。我們將介紹二代測序在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中的主要應(yīng)用:(1)疾病診斷(2)預(yù)后分層(3)靶向治療,以及(4)MRD監(jiān)測等。

  

  (1)疾病診斷:在部分血液系統(tǒng)惡性腫瘤中,同一基因在幾乎所有病例中都會反復(fù)發(fā)生突變。例如,Janus激酶2(JAK2)突變是真性紅細胞增多癥(PV)的一個決定性特征,PV是一種以外周血紅細胞增多癥為特征的骨髓增生性腫瘤。大約95%的PV病例在外顯子2中攜帶典型的JAK617p.Val14Phe突變,而其余病例基本上都以外顯子12中的多種框內(nèi)插入缺失為特征。因此,在紅細胞增多癥患者中,JAK2突變檢測具有巨大的診斷價值。即使沒有對外周血或骨髓進行顯微鏡檢查,JAK2突變的鑒定也支持骨髓增生性腫瘤,并且由于JAK2突變在PV中基本上普遍存在,因此陰性結(jié)果強烈提示患者紅細胞增多癥的其他原因(例如,由于患者經(jīng)常發(fā)生的低氧血癥伴有基礎(chǔ)肺部疾病)。表中列舉部分血液腫瘤中具有診斷意義的基因突變,NGS檢測能夠精準(zhǔn)發(fā)現(xiàn)這些惡性血液腫瘤的驅(qū)動突變,它為疾病診斷增加了客觀證據(jù)。

  

  (2)預(yù)后分層:除了提供診斷信息外,NGS還為血液系統(tǒng)惡性腫瘤的預(yù)后提供了價值。鑒于惡性血液腫瘤的侵襲性和結(jié)局的異質(zhì)性,風(fēng)險分層在急性白血病中尤為重要。例如,有利的NGS結(jié)果包括bZIP結(jié)構(gòu)區(qū)基因CEBPA突變或NPM1突變。相比之下,ASXL1、RUNX1和TP53的突變以及FLT3內(nèi)部串聯(lián)重復(fù)突變均與不良預(yù)后相關(guān)。NGS發(fā)現(xiàn)致病性突變,可以對個體患者的化療/移植的治療效果、復(fù)發(fā)風(fēng)險和預(yù)期生存率進行更精細的預(yù)測。

  (3)靶向治療:在過去幾年中,一些突變靶向藥物已開始在血液系統(tǒng)惡性腫瘤患者中顯示出希望。例如,F(xiàn)LT3突變AML的年輕患者現(xiàn)在常規(guī)接受替代誘導(dǎo)方案,包括FLT3抑制劑,如米多斯汀和吉替替尼。同樣,艾伏尼布和enasidenib已分別獲批用于治療IDH1和IDH2突變的AML患者。靶向藥物為一線治療失敗的患者提供了新的選擇,相信未來會出現(xiàn)更多更好的針對不同突變的靶向治療,而NGS檢測應(yīng)用是發(fā)現(xiàn)突變和輔助靶向治療的重要手段。

  (4)MRD監(jiān)測:基于NGS的克隆型序列MRD檢測現(xiàn)已在多種惡性腫瘤中得到廣泛應(yīng)用。例如,在漿細胞骨髓瘤中,疾病進展的風(fēng)險與治療后殘留的病灶豐度高度相關(guān)。在過往研究中,患有MRD的骨髓瘤患者<10^−5平均進展時間為80個月,而MRD>10^−3的患者為27個月。同樣,在B細胞ALL患兒中,基于NGS的MRD可預(yù)測復(fù)發(fā)風(fēng)險和生存率,其敏感性超過多參數(shù)流式細胞術(shù)的平均水平。

  總而言之,NGS已成為血液系統(tǒng)惡性腫瘤實驗室評估標(biāo)準(zhǔn)中不可或缺的工具。根據(jù)疾病的不同,突變數(shù)據(jù)可用于促進診斷、告知預(yù)后、指導(dǎo)治療選擇或監(jiān)測疾病。將NGS突變數(shù)據(jù)整合到血液系統(tǒng)惡性腫瘤的當(dāng)前形態(tài)學(xué)、免疫表型和細胞遺傳學(xué)分析中,將增強我們對白血病發(fā)生的理解,并為患者提供更精度化的臨床服務(wù)。

  以上內(nèi)容僅作為科普內(nèi)容,具體病例及情況需要咨詢醫(yī)生。希望患友們早日康復(fù)、重獲新生。[作者:羅煜燊 審核:李迪]

  

  

  主要研究方向為白血病耐藥機制及腫瘤生物治療。在單倍體相合造血干細胞移植、惡性血液病的精準(zhǔn)診斷以及惡性腫瘤的分子靶向及免疫細胞治療方面造詣深厚。擅長難治復(fù)發(fā)白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等惡性血液病的個體化免疫和分子靶向治療。承擔(dān)國家級、省市級科研項目20余項;申請專利14項,已授權(quán)國家發(fā)明專利10項、美國發(fā)明專利1項;在國內(nèi)外期刊發(fā)表論文100多篇,其中Nature Nanotechnology、Nature Biomedica lEngineering、Proc Natl Acad Sci USA 等重要SCI雜志收錄60余篇;獲軍隊科技進步二等獎1項,廣東省科技進步三等獎1項,廣東醫(yī)學(xué)科技二等獎1項,中國女醫(yī)師協(xié)會“五洲女子科技獎”1項,美國亞利桑那州立大學(xué)博士后科研獎1項。

  【出診時間】

  每周一上午名醫(yī)門診(門診七樓)

  每周二上午血液科門診(門診二樓)

  

  南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院血液科檢驗技師,實驗室基因測序組組長。負責(zé)血液腫瘤基因測序,擅長髓系白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等二代測序檢測,在測序文庫構(gòu)建、生物信息學(xué)分析和致病變異結(jié)果報告等方面經(jīng)驗豐富。學(xué)術(shù)成果有以第一作者SCI論文1篇,共發(fā)4篇中科院二區(qū)或以上SCI論文。

(責(zé)任編輯:華康)

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